Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nlrp4bQ8C6J9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nlrp4bQ8C6J9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.9 ms