Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssuh2Q8C3L1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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