Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Snx16Q8C080 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Snx16Q8C080 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx16Q8C080 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx16Q8C080 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx16Q8C080 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx16Q8C080 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx16Q8C080 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx16Q8C080 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Snx16Q8C080 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx16Q8C080 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms