Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Prl3a1-201ENSMUST00000049463 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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