Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TtpaQ8BWP5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms