Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Triml1Q8BVP1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Triml1Q8BVP1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms