Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms