Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cep55Q8BT07 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cep55Q8BT07 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms