Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cyp4f39Q8BGU0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cyp4f39Q8BGU0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cyp4f39Q8BGU0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cyp4f39Q8BGU0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cyp4f39Q8BGU0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms