Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg4bQ8BGE6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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