Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BGC1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BGC1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms