Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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