Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc172Q810N9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms