Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms