Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctdp1Q7TSG2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctdp1Q7TSG2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms