Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Actn1Q7TPR4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Actn1Q7TPR4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Actn1Q7TPR4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms