Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ScocQ78YZ6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ScocQ78YZ6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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