Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbtb39Q6PDK0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb39Q6PDK0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms