Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtss1lQ6P9S0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Mtss1lQ6P9S0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Mtss1lQ6P9S0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtss1lQ6P9S0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms