Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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