Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb1Q6NXM2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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