Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms