Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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