Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms