Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2bQ64511 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top2bQ64511 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms