Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms