Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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