Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms