Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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AtmQ62388 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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AtmQ62388 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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AtmQ62388 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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AtmQ62388 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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AtmQ62388 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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AtmQ62388 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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AtmQ62388 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtmQ62388 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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