Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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