Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms