Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Neurod1Q60867 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms