Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CttnQ60598 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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