Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myh1Q5SX40 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Myh1Q5SX40 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms