Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms