Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eme2Q56A04 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Eme2Q56A04 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms