Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Xirp2Q4U4S6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xirp2Q4U4S6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms