Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf38aQ4FK66 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms