Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms