Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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