Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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