Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms