Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ceacam12Q3UKP4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms