Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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