Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf180Q3U827 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rnf180Q3U827 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms