Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms