Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kdm4dQ3U2K5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms