Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c3Q3TMP1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms