Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca4Q3TKT4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarca4Q3TKT4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms