Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tmem248Q3TBN1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tmem248Q3TBN1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem248Q3TBN1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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